SIGENAE

Adress
Chemin de Borderouge - Auzeville 31320 Castanet Tolosan
Structure(s)
INRA
Unit:
Not documented
Regional Center
IFB South West
Scientific leader
Klopp Christophe
Technical leader
Not documented
Certificat(s)
Not documented
No website documented
Annual visits:
Not documented
Unique visits:
Not documented
Quotes:
Not documented
Downloads:
Not documented

PhyloFish transcriptome database

Description

http://phylofish.sigenae.org/index.html

Access conditions

public

No website documented
Annual visits:
Not documented
Unique visits:
Not documented
Quotes:
Not documented
Downloads:
Not documented

Gigaton oyster transcriptome database

Description

http://gigaton.sigenae.org/

http://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-015-0...

Access conditions

public

Domains of activity
  • Agri-food
  • Environment
  • Biology
Description of expertise domains

Analyse de données issues des technologies à haut débit : séqueçage et génotypage.
Développement de logiciel.
Bases de données

Formation professionnelle

No website documented
Trainees:
20 trainees / year
Training time:
1 day(s) / year
No upcoming session scheduled

Galaxy : first step

Description
 
Le programme de cette introduction à Galaxy est le suivant : présentation de Galaxy, se connecter à l’instance toulousaine, commencer à utiliser certains outils bioinformatiques standards, la gestion des fichiers dans galaxy. Découvrir les bonnes pratiques dans Galaxy. Organisée en collaboration avec la plateforme Bioinfo Genotoul.
Access conditions

Avoir un compte sur la plateforme Bioinfo Genotoul (demande via un formulaire web sur notre site), s’inscrire (via notre site web) et payer 150 euros la journée pour un académique et 500 euros la journée pour un privé.

Users distribution
International
5 %
National
75 %
Regional
0 %
Local
20%
Explanation about this distribution:

Sigenae traite des données et développe du logiciel pour les équipes de biologistes INRA des département de Génétique Animale, Santé Animale et Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage.

Platform's own projects

Not Documented

Collaborations
National projets
Not documented
International and European projects
Not documented
Projects with industry
Not documented
Collaboration projects not founded through an external organism
Not documented
Provision of services not founded through an external organism
Not documented
Animations (Workshops, Work-groups, seminars, conferences ... )
Not documented
Internal publications

Presque 300 publications disponibles sur: http://www.sigenae.org/index.php?id=156

External publications
Publications with the hosting laboratory
cea
cnrs
inra
inria
inserm
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