Type de formation: 
Formation professionnelle
Description: 

bilille propose un cycle de découverte de la bioinformatique à destination des chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs, techniciens et doctorants en biologie. Aucun pré-requis en informatique n'est attendu.

Le cycle est constitué de quatre modules de deux jours, qui peuvent être suivis indépendamment, mais ont une cohérence. Suivre chaque module peut aider à une meilleure compréhension des modules suivants.

  • 7-8 septembre 2016: Banques de données et BLAST
  • 24-25 novembre 2016: Alignements de séquences
  • 16-17 février 2017: Prédiction de gènes et annotation de protéines
  • 11-12 mai 2017: Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire

Les fiches descriptives des différents modules sont accessibles sur le site web de bilille.

Les objectifs du module 2 sont :

- Découvrir les différents types d'alignement pour les séquences protéiques et nucléiques
- Savoir choisir le logiciel et les paramètres adaptés à une problématique (alignement local, global, multiple...)
- Comprendre les méthodes algorithmiques pour l'alignement de séquences
- Comprendre les paramètres des logiciels
- Etre capable d'analyser un résultat d'alignement avec un regard critique

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Vincent Chouraki, Sylvain Legrand (mails)

Nombre de personnes formées: 
12/ an
Temps de formation: 
2 jours / an
Conditions d'accès à la formation: 

- Savoir utiliser un ordinateur (Windows…) : naviguer sur internet (Internet Explorer ou Firefox), utiliser un traitement de texte (Word ou OpenOffice).
- Etre familier avec les banques de données, Blast et formats de séquences (idéalement avoir suivi le module 1/4 « Banques de données et Blast » du cycle d'initiation à la bioinformatique).

Nombre de sessions: 
2
Date de la prochaine session: 
Jeudi, novembre 24, 2016 (All day) to Vendredi, novembre 25, 2016 (All day)
Lieu de la formation: 
Université de Lille
Cours résumé: 
Formation "Alignement de séquences"
Thème (formations professionnelles uniquement): 
cea
cnrs
inra
inria
inserm
logo_elixir
logo-investissements