Type de formation: 
Formation professionnelle
Description: 

bilille propose tout au long de l'année 2017 un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.

  • Analyses ADN, 2 sessions identiques, la première les 6 et 7 février 2017 et la seconde les 6 et 7 mars 2017
  • Analyses RNA-seq, du 5 au 7 avril 2017
  • Analyses ChIP-seq, les 12 et 13 juin 2017
  • Analyses de variants, du 2 au 4 octobre 2017
  • Métagénomique, du 6 au 8 décembre 2017

Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.

Les objectifs du module 3 sont :

Savoir analyser des données de ChIP-seq, du peak-calling à la découverte de motifs :
- Savoir détecter les pics et obtenir un signal
- Comprendre les différentes structures de données
- Savoir effectuer les contrôles qualité
- Savoir effectuer une analyse d'enrichissement de motifs
- Etre capable de préparer ses résultats pour leur annotation
- Comprendre comment croiser plusieurs résultats de ChIP-seq

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Vincent Chouraki, Sylvain Legrand (mails)

Nombre de personnes formées: 
12/ an
Temps de formation: 
2 jours / an
Conditions d'accès à la formation: 

- Etre familier avec la plate-forme web Galaxy (idéalement avoir suivi la formation bilille « Initiation à Galaxy »)
- Avoir suivi le module 1/5 « Analyses ADN » de ce cycle ou toute autre formation permettant de justifier de connaissances sur les données de séquençage haut débit et leur alignement. Savoir aligner les séquences pour obtenir un fichier bam à partir d'un fichier fastq.

Nombre de sessions: 
1
Date de la prochaine session: 
Lundi, juin 12, 2017 (All day) to Mardi, juin 13, 2017 (All day)
Lieu de la formation: 
Université de Lille
Cours résumé: 
Foramtion "Analyses ChIP-seq"
Thème (formations professionnelles uniquement): 
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