Type de formation: 
Formation professionnelle
Description: 

bilille propose tout au long de l'année 2017 un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.

  • Analyses ADN, 2 sessions identiques, la première les 6 et 7 février 2017 et la seconde les 6 et 7 mars 2017
  • Analyses RNA-seq, du 5 au 7 avril 2017
  • Analyses ChIP-seq, les 12 et 13 juin 2017
  • Analyses de variants, du 2 au 4 octobre 2017
  • Métagénomique, du 6 au 8 décembre 2017

Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.

Les objectifs du module 5 sont :

- Connaître les différentes méthodes de séquençage à haut débit pour la métagénomique, avec leurs avantages et leurs limites : métagénomique ciblée, métagénomique génomes entiers, métatranscriptomique
- Comprendre les différentes étapes analytiques du traitement bioinformatique des données et savoir les mettre en œuvre
- Savoir conduire une analyse statistique pour l’estimation de la richesse de la biodiversité
- Aller jusqu’aux conclusions biologiques

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Vincent Chouraki, Sylvain Legrand (mails)

Nombre de personnes formées: 
12/ an
Temps de formation: 
3 jours / an
Conditions d'accès à la formation: 

- Etre familier avec la plate-forme web Galaxy (idéalement avoir suivi la formation bilille « Initiation à Galaxy »)
- Avoir suivi le module 1/5 « Analyses ADN » de ce cycle ou toute autre formation permettant de justifier de connaissances sur les données de séquençage haut débit et leur alignement. Etre familier avec le vocabulaire et les étapes de base de l’analyse de données de séquençage : nettoyage, assemblage, mapping

Nombre de sessions: 
1
Date de la prochaine session: 
Mercredi, décembre 6, 2017 (All day) to Vendredi, décembre 8, 2017 (All day)
Lieu de la formation: 
Université de Lille
Cours résumé: 
Formation "Métagénomique"
Thème (formations professionnelles uniquement): 
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