bilille

Adresse postale
Batiment M3, Université de Lille Sciences et Technologies
Pôle recherche de la faculté de médecine, Université de Lille Droit et Santé 59000 Lille
Structure(s) :
CNRS
Unité :
CRIStAL, UMR 9189 (Université de Lille et CNRS)
Pôle regional :
IFB Nord Est
Website
bilille
Responsable Scientifique
Marot Guillemette
Responsable opérationnel
Non renseigné
Certificat(s)
  • France-Génomique
Aucun site web renseigné
Visites annuelles :
36 000 an
Visites uniques :
3 600 an
Citations :
150
Dernière mise à jour :
03-01-2015

Norine

Description

Norine is a public computational resource with a web interface and REST access to a knowledge-base of
nonribosomal peptides. It also contains dedicated tools : 2D graph viewer and editor, comparison of NRPs,
MyNorine, a tool allowing anybody to easly submit new nonribosomal peptides, Smiles2monomers (s2m), a
tool that deciphers the monomeric structure of polymers from their chemical structure.

Conditions d'accès

Accès libre et gratuit depuis le site web de la resource Norine.

Aucun site web renseigné
Visites annuelles :
Non renseignées
Visites uniques :
Non renseignées
Citations :
21
Téléchargements :
100

CRAC

Description

Méthode d'analyse de données RNA-seq.

Conditions d'accès

Gratuit via le site de la plateforme.

Aucun site web renseigné
Visites annuelles :
4 848 an
Visites uniques :
11 633 an
Citations :
4
Téléchargements :
Non renseigné

RNAspace

Description

RNAspace is a platform which aims at providing an integrated environment for non-coding RNA annotation.
The increasing number of ncRNA discovered since 2000 and the lack of user friendly tools for finding and annotating them, have made necessary to propose to biologists an in silico environment allowing structural and functional annotations of these molecules with regard to available protein genes annotation environments.
RNAspace makes available a variety of ncRNA gene finders and ncRNA databases as well as user-friendly tools to explore computed results including comparison, visualization and edition of putative RNAs. RNAspace also allows to export putative RNAs in various formats.

 

Conditions d'accès

Site web, sans condition.

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Visites annuelles :
Non renseignées
Visites uniques :
Non renseignées
Citations :
10
Téléchargements :
Non renseigné

Vidjil

Description

Objectif

Vidjil est une plate-forme logicielle open-source dédiée à l'analyse de données de séquençage haut-débit issues de lymphocytes. Les recombinaisons V(D)J dans les lymphocytes sont essentielles pour la diversité immunologique. Ils sont aussi des marqueurs utiles de pathologies et, pour la leucémie, ils sont utilisés pour quantifier le minimum résiduel de la maladie pendant la phase de rémission du patient. Le séquençage Haut-Débit (NGS/HTS) permet maintenant le séquençage exhaustif des populations lymphoïques avec des méthodes dédiées de Rep-Seq et les logiciels associés.

Description de l'outil

Vidjil est constitué de 3 parties : un algorithme, un visualisateur et un serveur qui permettent l'analyse de populations lymphocitaires qui contiennent des recombinaisons V(D)J.

L'algorithme haut-débit de Vidjil extrait les jonctions V(D)J et les regroupe en clones. Cette analyse est basée sur une heuristique à base de graine espacées et est rapide et évolutive, puisque, dans la première phase, aucun alignement n'est réalisé sur les séquences initiales de la base de données. Chaque séquence est assignée à un cluster selon sa jonction V(D)J. Puis, une séquence représentative de chaque cluster est calculée en un temps linéaire par rapport à la taille du cluster. Pour finir, nous réalisons un alignement complet par programmation dynamique de cette séquence représentative contre les séquences initiales.

Vidjil contient également un navigateur dynamique (en D3JS) pour visualiser et analiser les clones et leur évolution au cours du temps.

Conditions d'accès

Vidjil est open-source, sous la licence GNU GPLv3 (code disponible sur GitHub). Le browser peut-être utilisé via le web et une version en ligne de commande peut-être téléchargée (cf. page d'accueil).

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Visites annuelles :
Non renseignées
Visites uniques :
Non renseignées
Citations :
53
Téléchargements :
Non renseigné

SortMeRNA

Description

Objectif

SortMeRNA est un outil d'analyse de séquences biologiques pour le filtrage de données méta-transcriptomiques et méta-génomiques, le mapping et la sélection d'OTU (unité taxonomique opérationnelle). La principale application de SortMeRNA est le filtrage et le mapping d'ARN ribosomiques à partir de données NGS.

Description de l'outil

L'algorithme principal est basé sur des graines approchées, ainsi qu'une structure d'indexation de texte optimisée. Il permet des analyses rapides et sensibles de séquences nucléiques.

SortMeRNA prend en entrée un fichier de reads (au format fasta ou fastq) et un ou plusieurs fichier(s) de base(s) de données d'ARNr. Il en extrait les ARNr et les reads refusésdans 2 fichiers. Sur demande, il peut fournir des alignements locaux de haute qualité des reads d'ARNr contre les ARNr des bases de données. SortMeRNA fonctionne avec des données Illumina, 454, Ion Torrent et PacBio et produit en sortie des alignements de type SAM ou Blast. Il est implémenté en C++.

Conditions d'accès

SortMeRNA est distribué gratuitement sous licence LGPL.

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Visites annuelles :
Non renseignées
Visites uniques :
Non renseignées
Citations :
Non renseigné
Téléchargements :
Non renseigné

miRkwood

Description

Objectif

miRkwood est un pipeline bioinformatique qui permet l'identification rapide et facile de microARN à partir de génomes de plantes. Il offre une interface intuitive pour naviguer dans les données, ainsi que de nombreuses options d'export pour permettre à l'utilisateur de mener des analyses plus poussées sur un ordinateur personnel

Description du logiciel

miRkwood prend en entrée un ensemble de petits reads, qui ont été préalablement alignés sur le génome de référence. Il identifie de nouveaux microARN en se basant sur la distribution des reads et la capacité des régions flanquantes à se replier en des structures de type tige-boucle. Puis, le résultat est affiné à l'aide d'une variété de fonctionnalités supplémentaires qui ajoutent de nouveaux éléments probants à la prédiction : stabilité du duplexe, stabilité thermodynamique, conservation phylogénétique, répétitions, etc.

Conditions d'accès

miRkwood est accessible via un serveur web et en tant qu'application stand-alone.

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Visites annuelles :
Non renseignées
Visites uniques :
Non renseignées
Citations :
90
Téléchargements :
Non renseigné

Carnac

Description

Carnac est un logiciel d'analyse de structures secondaires d'une famille d'ARN homologues. Il permet de prédire si les séquences partagent réellement une structure secondaire commune. Lorsque cette structure existe, Carnac est capable de détecter une grande partie des tiges. L'entrée du programme est un ensemble de séquences d'ARN simple brin non alignées. La stratégie de repliement s'appuie sur un modèle thermodynamique qui minimise l'énergie. Elle associe l'information provenant des conservations locales de la structure primaire avec celle des covariations entre séquences.

Conditions d'accès

Carnac peut être utilisé via une interface web ou être téléchargé pour être installé localement (un compilateur C est nécessaire). Une version exécutable sous Windows est également disponible.

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Visites annuelles :
Non renseignées
Visites uniques :
Non renseignées
Citations :
Non renseigné
Téléchargements :
Non renseigné

Galaxy - MPAgenomics

Description

Intégration du package MPAgenomics à Galaxy.
Création et déploiement d'une instance d'une instance publique de Galaxy

Conditions d'accès

Galaxy MPAgenomics est accessible via le cloud de l'IFB Core.

Domaines d'activité
  • Informatique
  • Biologie
  • Biomédical
  • Environnement
Mots clés:
  • Analyse de données de séquençage NGS
  • Méthodologie
  • Assemblage de génomes et transcriptomes
  • Alignements de lectures sur des génomes
  • Génomique (DNA-seq)
  • Analyse de génomes
  • Annotation structurale et fonctionnelle des génomes
  • Transcriptomique (RNA-seq)
  • Analyse différentielle de l’expression des gènes
  • Analyses de transcrits et transcrits variants
  • Analyse de variants
  • Panels (amplicons, captures)
  • Exomes
  • Analyse de la régulation de l’expression des gènes
  • Chip-seq
  • Petits et longs ARN non-codants
  • Métagénomique, métatranscriptomique
  • Analyse de séquences
  • Algorithmique des séquences
  • Alignement (multiple) de séquences
  • Annotation de séquences
  • Recherche de motifs
  • Bioinformatique structurale
  • Biostatistiques
  • Statistique descriptive
  • Tests statistiques
  • Régression
  • Analyses multivariées
  • Réduction de dimension
  • Développements technologiques de l‘Information et de la Communication
  • Outils
  • Intégration d'outils
  • Interopérabilité
  • Interfaces, portails web
  • Développement de workflows
  • Données
  • Intégration de données
  • Gestion et transfert de données
  • Bases de données et systèmes d’informations
  • Evolution et phylogénie
  • Evolution moléculaire
  • Gènes et génomes
  • Génomique comparative
  • Comparaison des génomes
  • Génomique : Puces
  • Biopuces ADN
  • CGH
  • Biopuces ARN
  • Expression
  • Immunogénétique
  • Analyse de répertoires immunitaires
  • Immunoinformatique
  • Protéomique
  • Analyse différentielle statistique

Formation professionnelle

Personnes formées :
12 personnes / an
Temps de formation :
2 jour(s) / an
Prochaine session :
06-02-2017

Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 1/5 : Analyses ADN

Description
bilille propose tout au long de l'année 2017 un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.
  • Analyses ADN, 2 sessions identiques, la première les 6 et 7 février 2017 et la seconde les 6 et 7 mars 2017
  • Analyses RNA-seq, du 5 au 7 avril 2017
  • Analyses ChIP-seq, les 12 et 13 juin 2017
  • Analyses de variants, du 2 au 4 octobre 2017
  • Métagénomique, du 6 au 8 décembre 2017

Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.

Les objectifs du module 1 sont :

- Apprendre à manipuler des données de séquençage d’ADN
- Présenter les méthodes et outils d'alignement et d'assemblage
- Réaliser des contrôles de qualité et des alignements sur une référence
- Utiliser la plateforme Galaxy pour ces analyses

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Vincent Chouraki, Sylvain Legrand (mails)

Conditions d'accès

Etre familier avec la plate-forme web Galaxy (idéalement avoir suivi la formation bilille « Initiation à Galaxy »)

Personnes formées :
12 personnes / an
Temps de formation :
3 jour(s) / an
Prochaine session :
05-04-2017

Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 2/5 : Analyses RNA-seq

Description

bilille propose tout au long de l'année 2017 un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.

  • Analyses ADN, 2 sessions identiques, la première les 6 et 7 février 2017 et la seconde les 6 et 7 mars 2017
  • Analyses RNA-seq, du 5 au 7 avril 2017
  • Analyses ChIP-seq, les 12 et 13 juin 2017
  • Analyses de variants, du 2 au 4 octobre 2017
  • Métagénomique, du 6 au 8 décembre 2017

Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.

Les objectifs du module 2 sont :

- Savoir réaliser une analyse transcriptomique par RNA-seq avec ou sans (de novo) génome de référence à l’aide du portail Galaxy
- Avoir un regard critique sur la qualité des lectures obtenues par le séquenceur
- Connaître et savoir paramétrer les outils nécessaires à l’analyse
- Connaître les méthodes de normalisation des données et d’analyse différentielle

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Vincent Chouraki, Sylvain Legrand (mails)

Conditions d'accès

Etre familier avec la plate-forme web Galaxy (idéalement avoir suivi la formation bilille « Initiation à Galaxy »)

Avoir suivi le module 1/5 « Analyses ADN » de ce cycle ou toute autre formation permettant de justifier de connaissances sur les données de séquençage haut débit et leur alignement.

Personnes formées :
12 personnes / an
Temps de formation :
2 jour(s) / an
Prochaine session :
12-06-2017

Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 3/5 : Analyses ChIP-seq

Description

bilille propose tout au long de l'année 2017 un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.

  • Analyses ADN, 2 sessions identiques, la première les 6 et 7 février 2017 et la seconde les 6 et 7 mars 2017
  • Analyses RNA-seq, du 5 au 7 avril 2017
  • Analyses ChIP-seq, les 12 et 13 juin 2017
  • Analyses de variants, du 2 au 4 octobre 2017
  • Métagénomique, du 6 au 8 décembre 2017

Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.

Les objectifs du module 3 sont :

Savoir analyser des données de ChIP-seq, du peak-calling à la découverte de motifs :
- Savoir détecter les pics et obtenir un signal
- Comprendre les différentes structures de données
- Savoir effectuer les contrôles qualité
- Savoir effectuer une analyse d'enrichissement de motifs
- Etre capable de préparer ses résultats pour leur annotation
- Comprendre comment croiser plusieurs résultats de ChIP-seq

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Vincent Chouraki, Sylvain Legrand (mails)

Conditions d'accès

- Etre familier avec la plate-forme web Galaxy (idéalement avoir suivi la formation bilille « Initiation à Galaxy »)
- Avoir suivi le module 1/5 « Analyses ADN » de ce cycle ou toute autre formation permettant de justifier de connaissances sur les données de séquençage haut débit et leur alignement. Savoir aligner les séquences pour obtenir un fichier bam à partir d'un fichier fastq.

Personnes formées :
12 personnes / an
Temps de formation :
3 jour(s) / an
Prochaine session :
02-10-2017

Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 4/5 : Analyses de variants

Description

bilille propose tout au long de l'année 2017 un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.

  • Analyses ADN, 2 sessions identiques, la première les 6 et 7 février 2017 et la seconde les 6 et 7 mars 2017
  • Analyses RNA-seq, du 5 au 7 avril 2017
  • Analyses ChIP-seq, les 12 et 13 juin 2017
  • Analyses de variants, du 2 au 4 octobre 2017
  • Métagénomique, du 6 au 8 décembre 2017

Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.

Les objectifs du module 4 sont :

- Comprendre les grands principes de la détection de variants
- Réaliser les différentes étapes du post-traitement des données d’alignement à la détection de variants
- Adapter l’analyse en fonction du type de données NGS générées
- Comprendre la structure des données de variants
- Savoir annoter des variants
- Etre capable d’interpréter une liste de variants grâce aux outils libres disponibles

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Vincent Chouraki, Sylvain Legrand (mails)

Conditions d'accès

- Etre familier avec la plate-forme web Galaxy (idéalement avoir suivi la formation bilille « Initiation à Galaxy »)
- Avoir suivi le module 1/5 « Analyses ADN » de ce cycle ou toute autre formation permettant de justifier de connaissances sur les données de séquençage haut débit et leur alignement

Personnes formées :
12 personnes / an
Temps de formation :
3 jour(s) / an
Prochaine session :
06-12-2017

Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module 5/5 : Métagénomique

Description

bilille propose tout au long de l'année 2017 un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.

  • Analyses ADN, 2 sessions identiques, la première les 6 et 7 février 2017 et la seconde les 6 et 7 mars 2017
  • Analyses RNA-seq, du 5 au 7 avril 2017
  • Analyses ChIP-seq, les 12 et 13 juin 2017
  • Analyses de variants, du 2 au 4 octobre 2017
  • Métagénomique, du 6 au 8 décembre 2017

Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.

Les objectifs du module 5 sont :

- Connaître les différentes méthodes de séquençage à haut débit pour la métagénomique, avec leurs avantages et leurs limites : métagénomique ciblée, métagénomique génomes entiers, métatranscriptomique
- Comprendre les différentes étapes analytiques du traitement bioinformatique des données et savoir les mettre en œuvre
- Savoir conduire une analyse statistique pour l’estimation de la richesse de la biodiversité
- Aller jusqu’aux conclusions biologiques

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Vincent Chouraki, Sylvain Legrand (mails)

Conditions d'accès

- Etre familier avec la plate-forme web Galaxy (idéalement avoir suivi la formation bilille « Initiation à Galaxy »)
- Avoir suivi le module 1/5 « Analyses ADN » de ce cycle ou toute autre formation permettant de justifier de connaissances sur les données de séquençage haut débit et leur alignement. Etre familier avec le vocabulaire et les étapes de base de l’analyse de données de séquençage : nettoyage, assemblage, mapping

Personnes formées :
12 personnes / an
Temps de formation :
2 jour(s) / an
Prochaine session :
07-09-2016

Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 1/4 : Banques de données et Blast

Description

bilille propose un cycle de découverte de la bioinformatique à destination des chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs, techniciens et doctorants en biologie. Aucun pré-requis en informatique n'est attendu.

Le cycle est constitué de quatre modules de deux jours, qui peuvent être suivis indépendamment, mais ont une cohérence. Suivre chaque module peut aider à une meilleure compréhension des modules suivants.

  • 7-8 septembre 2016: Banques de données et BLAST
  • 24-25 novembre 2016: Alignements de séquences
  • 16-17 février 2017: Prédiction de gènes et annotation de protéines
  • 11-12 mai 2017: Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire

Les fiches descriptives des différents modules sont accessibles sur le site web de bilille.

Les objectifs du module 1 sont :

- Découvrir différentes banques de données de séquences généralistes
- Savoir interroger les banques de données et réaliser des requêtes pertinentes
- Comprendre la structure des données
- Savoir utiliser de manière optimale le logiciel Blast en fonction de l'application visée (ex : recherche d’homologie, prédiction de gènes…)
- Etre capable d'analyser un résultat avec un regard critique

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Vincent Chouraki, Sylvain Legrand (mails)

Conditions d'accès

Savoir utiliser un ordinateur (Windows...) : naviguer sur internet (Internet Explorer ou Firefox), utiliser un traitement de texte (Word ou OpenOffice).

Personnes formées :
12 personnes / an
Temps de formation :
2 jour(s) / an
Prochaine session :
24-11-2016

Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 2/4 : Alignement de séquences

Description

bilille propose un cycle de découverte de la bioinformatique à destination des chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs, techniciens et doctorants en biologie. Aucun pré-requis en informatique n'est attendu.

Le cycle est constitué de quatre modules de deux jours, qui peuvent être suivis indépendamment, mais ont une cohérence. Suivre chaque module peut aider à une meilleure compréhension des modules suivants.

  • 7-8 septembre 2016: Banques de données et BLAST
  • 24-25 novembre 2016: Alignements de séquences
  • 16-17 février 2017: Prédiction de gènes et annotation de protéines
  • 11-12 mai 2017: Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire

Les fiches descriptives des différents modules sont accessibles sur le site web de bilille.

Les objectifs du module 2 sont :

- Découvrir les différents types d'alignement pour les séquences protéiques et nucléiques
- Savoir choisir le logiciel et les paramètres adaptés à une problématique (alignement local, global, multiple...)
- Comprendre les méthodes algorithmiques pour l'alignement de séquences
- Comprendre les paramètres des logiciels
- Etre capable d'analyser un résultat d'alignement avec un regard critique

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Vincent Chouraki, Sylvain Legrand (mails)

Conditions d'accès

- Savoir utiliser un ordinateur (Windows…) : naviguer sur internet (Internet Explorer ou Firefox), utiliser un traitement de texte (Word ou OpenOffice).
- Etre familier avec les banques de données, Blast et formats de séquences (idéalement avoir suivi le module 1/4 « Banques de données et Blast » du cycle d'initiation à la bioinformatique).

Personnes formées :
12 personnes / an
Temps de formation :
2 jour(s) / an
Prochaine session :
16-02-2017

Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 3/4 : Prédiction de gènes et annotation de protéines

Description

bilille propose un cycle de découverte de la bioinformatique à destination des chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs, techniciens et doctorants en biologie. Aucun pré-requis en informatique n'est attendu.

Le cycle est constitué de quatre modules de deux jours, qui peuvent être suivis indépendamment, mais ont une cohérence. Suivre chaque module peut aider à une meilleure compréhension des modules suivants.

  • 7-8 septembre 2016: Banques de données et BLAST
  • 24-25 novembre 2016: Alignements de séquences
  • 16-17 février 2017: Prédiction de gènes et annotation de protéines
  • 11-12 mai 2017: Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire

Les fiches descriptives des différents modules sont accessibles sur le site web de bilille.

Les objectifs du module 3 sont :

- découvrir les logiciels liés à la prédiction de gènes et à l'annotation de protéines
- acquérir la méthodologie pour prédire les gènes présents sur un génome qu'il soit bactérien ou eucaryote
- acquérir la méthodologie pour analyser la séquence protéique prédite et en déduire la fonction possible de la protéine, avoir une idée de sa localisation cellulaire et de sa structure
- être capable d'analyser les résultats obtenus par les logiciels avec un regard critique

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Vincent Chouraki, Sylvain Legrand (mails)

Conditions d'accès

- Savoir utiliser un ordinateur (Windows...) : naviguer sur internet (Internet Explorer ou Firefox), utiliser un traitement de texte (Word ou OpenOffice).
- Être familié avec les banques de données, Blast, formats de séquences et alignements de séquences (idéalement avoir suivi le module 1/4 « Banques de données et Blast » et le module 2/4 « Alignements de séquences » du cycle d'initiation à la bioinformatique).

Personnes formées :
12 personnes / an
Temps de formation :
2 jour(s) / an
Prochaine session :
11-05-2017

Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 4/4 : Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire

Description

bilille propose un cycle de découverte de la bioinformatique à destination des chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs, techniciens et doctorants en biologie. Aucun pré-requis en informatique n'est attendu.

Le cycle est constitué de quatre modules de deux jours, qui peuvent être suivis indépendamment, mais ont une cohérence. Suivre chaque module peut aider à une meilleure compréhension des modules suivants.

  • 7-8 septembre 2016: Banques de données et BLAST
  • 24-25 novembre 2016: Alignements de séquences
  • 16-17 février 2017: Prédiction de gènes et annotation de protéines
  • 11-12 mai 2017: Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire

Les fiches descriptives des différents modules sont accessibles sur le site web de bilille.

Les objectifs du module 4 sont :

- Comprendre les grands principes de l’évolution moléculaire et de la reconstruction phylogénétique
- Savoir construire des alignements informatifs pour une analyse phylogénétique
- Comprendre les modèles phylogénétiques probabilistes, les méthodes d'inférence et savoir les appliquer
- Savoir reconstruire des arbres phylogénétiques en Maximum de vraisemblance (ML) et par Inférence Bayésienne (BI)
- Etre capable d’analyser avec un regard critique les résultats obtenus

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Vincent Chouraki, Sylvain Legrand (mails)

Conditions d'accès

- Il est conseillé mais non nécessaire d’avoir suivi le module 1/4 « Banques de données et Blast » et le module 2/4 « Alignements de séquences » du cycle d'initiation à la bioinformatique.

Personnes formées :
12 personnes / an
Temps de formation :
1 jour(s) / an
Prochaine session :
08-11-2016

Initiation à Galaxy

Description

bilille organise une formation d'initiation à Galaxy, destinée aux biologistes ou médecins désirant découvrir le traitement bioinformatique de données via une interface conviviale. Galaxy est très répandu pour l’analyse de données omiques, telles que données de séquençage ou données de puces à ADN. Cette initiation à Galaxy est une formation interne à bilille.
 

Conditions d'accès
Non renseigné
Publications externes
Publications avec le laboratoire d'hébergement
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