SIGENAE

Adresse postale
Chemin de Borderouge - Auzeville 31320 Castanet Tolosan
Structure(s) :
INRA
Unité :
Non renseignée
Pôle regional :
IFB Sud Ouest
Responsable Scientifique
Klopp Christophe
Responsable opérationnel
Non renseigné
Certificat(s)
Non renseigné
Aucun site web renseigné
Visites annuelles :
Non renseignées
Visites uniques :
Non renseignées
Citations :
Non renseigné
Téléchargements :
Non renseigné

PhyloFish transcriptome database

Description

http://phylofish.sigenae.org/index.html

Conditions d'accès

public

Aucun site web renseigné
Visites annuelles :
Non renseignées
Visites uniques :
Non renseignées
Citations :
Non renseigné
Téléchargements :
Non renseigné

Gigaton oyster transcriptome database

Description

http://gigaton.sigenae.org/

http://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-015-0...

Conditions d'accès

public

Domaines d'activité
  • Agro-alimentaire
  • Environnement
  • Biologie
Description des expertises

Analyse de données issues des technologies à haut débit : séqueçage et génotypage.
Développement de logiciel.
Bases de données

Formation professionnelle

Aucun site web renseigné
Personnes formées :
20 personnes / an
Temps de formation :
1 jour(s) / an
Pas de nouvelle session prévue

Galaxy : first step

Description
 
Le programme de cette introduction à Galaxy est le suivant : présentation de Galaxy, se connecter à l’instance toulousaine, commencer à utiliser certains outils bioinformatiques standards, la gestion des fichiers dans galaxy. Découvrir les bonnes pratiques dans Galaxy. Organisée en collaboration avec la plateforme Bioinfo Genotoul.
Conditions d'accès

Avoir un compte sur la plateforme Bioinfo Genotoul (demande via un formulaire web sur notre site), s’inscrire (via notre site web) et payer 150 euros la journée pour un académique et 500 euros la journée pour un privé.

Répartition des utilisateurs
Internationaux
5 %
Nationaux
75 %
Régionaux
0 %
Locaux
20%
Description de la répartition :

Sigenae traite des données et développe du logiciel pour les équipes de biologistes INRA des département de Génétique Animale, Santé Animale et Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage.

Projets propres de la plateforme

Aucun (ou non renseigné)

Collaborations
Projets d'ANR
Non renseigné
Projets européens et internationaux
Non renseigné
Projets avec des industriels
Non renseigné
Projets de collaboration non financés par un organisme extérieur
Non renseigné
Prestations de service non financés par un organisme extérieur
Non renseigné
Animations
Non renseigné
Publications internes

Presque 300 publications disponibles sur: http://www.sigenae.org/index.php?id=156

Publications externes
Publications avec le laboratoire d'hébergement
cea
cnrs
inra
inria
inserm
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