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Boite à outils pour manipuler des données NGS : en particulier de type RNA-Seq, ChiP-Seq. Plus généralement il permet de comparer des annotations sur la base de leur localisation. S-MART fournit également de nombreuses façons de visualiser vos données: taille des reads, de la densité sur le génome, la distance par rapport à un ensemble de référence, et la corrélation des deux ensembles de données (avec des nuages de points).

Zytnicki M, Quesneville H (2011) S-MART, A Software Toolbox to Aid RNA-seq Data Analysis. PLoS ONE 6(10): e25988. doi:10.1371/journal.pone.0025988

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Citations: 
17
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81
Conditions d'accès: 

Disponible en téléchargement : https://urgi.versailles.inra.fr/Tools/S-Mart

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