Type de formation: 
Formation professionnelle
Description: 

bilille propose chaque année un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.

Ce cycle est composé de 5 modules, à la carte : 

- Module 1: Analyses ADN

- Module 2: Analyses de variants

- Module 3: Analyses RNA-seq, bioinformatique

- Module 4: Analyses RNA-seq, biostatistique

- Module 5: Métagénomique

Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.

Les objectifs du module 3 sont :

- Savoir réaliser une analyse transcriptomique par RNA-seq avec ou sans (de novo) génome de référence à l’aide du portail Galaxy
- Avoir un regard critique sur la qualité des lectures obtenues par le séquenceur
- Connaître et savoir paramétrer les outils nécessaires à l’analyse

Contacts: Guillaume Brysbaert, Ségolène Caboche, Sylvain Legrand (mails)

Nombre de personnes formées: 
12/ an
Temps de formation: 
2 jours / an
Conditions d'accès à la formation: 

Etre familier avec la plate-forme web Galaxy (idéalement avoir suivi la formation bilille « Initiation à Galaxy »)

Avoir suivi le module 1/5 « Analyses ADN » de ce cycle ou toute autre formation permettant de justifier de connaissances sur les données de séquençage haut débit et leur alignement.

Nombre de sessions: 
1
Date de la session: 
Jeudi, juin 13, 2019 (All day) to Vendredi, juin 14, 2019 (All day)
Lieu de la formation: 
Université de Lille
Cours résumé: 
Formation "Analyses RNA-seq - partie 1"
Thème (formations professionnelles uniquement): 
Nombre de jours: 
2.00
Taux de satisfaction des apprenants: 
100%
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