Welcome to the French Institute of Bioinformatics.

The Institut Français de Bioinformatique (IFB, French Institute of Bioinformatics) is a national service infrastructure in bioinformatics that was created following the call for proposals, “National Infrastructures in Biology and Health”, of the “Investments for the Future” initiative (ANR-11-INBS-0013).

This project gathers together the bioinformatics platforms of the main French research organizations, CNRS, INRA, INRIA, CEA and INSERM, as well as CIRAD, the Pasteur and Curie Institutes, and the French universities.

Services

Access to IFB resourcesIT Infrastructure

Access to computational or storage resources

IFB services rely on a physical infrastructure network with a software environment, thus ensuring access and processing of biological data.

Appel à projetsHelp

Supporting projects

Biologists, bioinformaticians, industrialists, the IFB can support projects or assist you in their maturation.

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Resources

IFB ensures the visibility and accessibility of bioinformatic resources

FORMATIONSTraining events

IFB Training events

IFB offers a large number of training courses, short or long, initial or professional and in all areas of bioinformatics.

News

  • Monday, March 2, 2020 to Friday, June 19, 2020

    Diplôme Universitaire en Bioinformatique Intégrative : DU-Bii 2020

    L'université Paris Diderot propose en partenariat avec l'Institut Français de Bioinformatique (IFB) la deuxième édition du Diplôme Universitaire en Bioinformatique intégrative (DU-Bii). Le DU-Bii fournira une formation théorique et pratique, complétée par une période d'immersion sur l'une des plateformes régionales de l'IFB.

    En savoir plus
  • Thursday, July 4, 2019

    IFB Activity report 2017–2018

     

    The French Institute of Bioinformatics publishes its 2017-2018 activity report. This document is the inventory of the start of actions planned for 2018-21. it also allows us to present the regional platforms, give indicators that reflects our dynamism and specify the new organizational structures.

    Acces to activity report
  • Monday, June 17, 2019

    A new tutorial in the Galaxy Training Network directory from the ProteoRE’s team

    The ProteoRE’s team is pleased to announce the publication of a new tutorial in the Galaxy Training Network directory. As a new training material for proteomics workflows in Galaxy, this tutorial is dedicated to the selection of candidate biomarkers; it illustrates how to use ProteoRE’s tools to design a strategy in a stepwise manner for reproducible biomarker selection relating to disease pathophysiology.

    Access training material
  • Wednesday, June 5, 2019

    New Paper on Plant Phenotyping data management

    New paper on Plant Data Information System (IS): "Applying FAIR Principles to Plant Phenotypic Data Management in GnpIS".. It uses the main Plant Phenotyping data standards (MIAPPE, Crop Ontology and BrAPI ) to publish integrated data acquired by experimental data IS like PHIS .

    En savoir plus
  • Saturday, May 11, 2019

    Nouvel article Gigascience décrivant Gigwa v2

    Gigwa est un outil web convivial pour gérer et explorer les données de génotypage haut débit de toutes espèces. Il offre des fonctionnalités de filtration avancées, gère métadonnées et annotations fonctionnelles ainsi que plusieurs formats d'import / export, et implémente 2 APIs REST. Un travail collaboratif du groupe South Green.

    Gigwa v2
  • Tuesday, May 21, 2019 to Thursday, May 23, 2019

    Présentation du projet pilote ProMetIS

    Alyssa Imbert, CDD du projet pilote ProMetIS donna fin mai une présentation orale de l’avancement du projet à la conférence annuelle du Réseau Français de métabolomique et Fluxomique

    12émes journées scientifiques du RFMF

Noeud français Elixir

logo_elixir

ELIXIR est une organisation intergouvernementale qui développe une infrastructure Européenne distribuée permettant aux scientifiques dans le domaine des sciences de la vie d’accéder à des ressources telles que des bases de données, des outils logiciels, du matériel de formation, du stockage cloud et des clusters de calcul.

La mission d'Elixir-FR est de doter la communauté bioinformatique française d'outils et d'expertise afin d'améliorer son offre de services auprès des chercheurs. Elixir-FR assure la pérennité des ressources bioinformatiques nationales, participe au développement d'une infrastructure durable de stockage, de traitement et d'analyse des données des sciences de la vie et donne accès à des outils et formations pour faciliter ces activités. Plus d'infos

IFB est le nœud français d'ELIXIR

 

Upcoming events

  • From 12-09-2019 to 13-09-2019

    Initiation au langage R

    Apprendre les principales fonctionnalités du langage R et ses principes
    Jouy en Josas
  • From 16-09-2019 to 18-09-2019

    Analyse de données métagénomiques 16S

    Cette formation est dédiée à l'analyse de données de type "metabarcoding" issues de la technologie de...
    Jouy en Josas
  • From 25-09-2019 to 27-09-2019

    Assemblage de transcriptome

    Assemblage de novo des transcrits avec Trinity...
    Montpellier
  • From 26-09-2019 to 27-09-2019

    Analyse statistique de données RNA-Seq...

    Se sensibiliser aux concepts et méthodes statistiques pour l'analyse de données transcriptomiques de type RNA-Seq.
    Jouy en Josas
  • From 01-10-2019 to 01-10-2019

    RNASeq Analysis with Galaxy

    RNASeq Analysis with Galaxy
    Roscoff
  • From 07-10-2019 to 11-10-2019

    Phylogénie moléculaire

    Introduction théorique et pratique de la phylogénie moléculaire
    Montpellier
  • From 15-10-2019 to 15-10-2019

    Modify and extract information from larg...

    Modify and extract information from large text files
    INRA Auzeville-Tolosane
  • From 21-10-2019 to 21-10-2019

    Intiation aux analyses de données NGS -...

    Une formation offrant des connaissances pluridisciplinaires dans le domaine de la bioinformatique...
    Montpellier
  • From 22-10-2019 to 23-10-2019

    R introduction

    Cette formation a pour objectif d' acquérir les bases pour l'utilisation du langage R.
    Centre de bioinformatique de Bordeaux (CGFB)
  • From 24-10-2019 to 25-10-2019

    Analyses NGS avec R

    savoir analyser des séquences de reads NGS, déterminer les ARN messagers différentiellement exprimés et enrichir les...
    Centre de bioinformatique de Bordeaux (CGFB)
  • From 29-10-2019 to 31-10-2019

    Analyse avancée de séquences

    Cette formation a pour objectif de : savoir rechercher des informations dans les banques de données, maîtriser les outils...
    Centre de bioinformatique de Bordeaux (CGFB)
  • From 03-11-2019 to 08-11-2019

    8ème école de bioinformatique AVIESAN-IF...

    Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit
    la Station biologique de Roscoff
  • From 04-11-2019 to 04-11-2019

    Intiation aux analyses de données NGS -...

    Une formation offrant des connaissances pluridisciplinaires dans le domaine de la bioinformatique...
    Montpellier
  • From 18-11-2019 to 22-11-2019

    Formation MicroScope 2019

    Annotation & Analysis Of Prokaryotic Genomes Using The MicroScope Platform
    Université Evry Paris-Saclay
  • From 18-11-2019 to 22-11-2019

    ELIXIR Biohackathon 2019

    BioHackathon activities are driven by practical sessions where people gather, discuss, and implement ideas/projects
    Paris area (berges de Seine)
  • From 02-12-2019 to 06-12-2019

    Metabarcode

    Metabarcode
    Roscoff
  • From 11-01-2020 to 11-01-2020

    Administration avancée de HPC à destinat...

    utilisation avancée de l'administration de HPC à destination d'administrateurs systèmes d'Afrique de l'...
    Université de Ouagadougou, Burkina faso
  • From 02-03-2020 to 19-06-2020

    DIPLÔME UNIVERSITAIRE EN BIOINFORMATIQUE...


    Université Paris Diderot
  • From 16-03-2020 to 20-03-2020

    Formation MicroScope 2020 session 1

    Annotation & Analysis Of Prokaryotic Genomes Using The MicroScope Platform
    Université Evry Paris-Saclay
  • From 23-11-2020 to 27-11-2020

    Formation MicroScope 2020 session 2

    Annotation & Analysis Of Prokaryotic Genomes Using The MicroScope Platform
    Université Evry Paris-Saclay

Job offer

  • Research Engineer in Bioinformatics for Proteomics
    Position:
    CDI
    Duration:
    CDI - Permanent
    Start date:
    December 2019
    Plateforme:
    Pasteur
    Ville:
    Paris
    Missions:

    The Institut Pasteur is a non-profit private foundation dedicated to
    fundamental, interdisciplinary research and to translating scientific
    knowledge to medicine and public health....

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  • Information génomique et structurale
    Position:
    CDI / concours cnrs
    Duration:
    Start date:
    Plateforme:
    Ville:
    marseille
    Missions:

    L'agent viendra renforcer l'équipe bioinformatique/génomique expérimentée du laboratoire (un professeur, un CR, un IR, 2 IE), en proposant et mettant en œuvre des solutions innovantes pour l'...

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  • Ingénieur en bioinformatique
    Position:
    CDD
    Duration:
    CDD de 3 mois reconductible et évolution vers CDI si travail sérieux.
    Start date:
    Juillet
    Plateforme:
    Autres
    Ville:
    MARSEILLE
    Missions:

    Assemblage, annotations structurale et fonctionnelle, génomique
    comparative et phylogénie à partir de génomes microbiens issus de
    plateformes de séquençage (principalement Illumina et...

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  • Développeur et gestionnaire de données en bioinformatiques (H/F)
    Position:
    CDD Technique/Administratif
    Duration:
    18 mois
    Start date:
    1 juin 2019
    Plateforme:
    IFB-core
    Ville:
    EVRY
    Missions:

    - Développer un service mutualisé d'espace de stockage et partage de
    données, accessible aux différentes INBS, hébergé sur les ressources matérielles de l'IFB.
    - Monter en compétence...

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  • Ingénieur Bioinformaticien (H/F) « single-cell RNAseq »
    Position:
    CDD
    Duration:
    16 mois
    Start date:
    01/06/2019
    Plateforme:
    Ville:
    Marseille
    Missions:

    L’équipe de Pierre Milpied est spécialisée dans les approches
    intégratives « single-cell » pour l’étude des processus de
    différenciation et de maturation des lymphocytes B dans le...

    Show more
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