Le cloud de l’IFB offre, à la demande, des ressources de calcul et des données de référence. Les utilisateurs pourront ainsi, soit déployer des appliances (machines préconfigurées), soit installer leur propre infrastructure bioinformatique. Suivant les cas de figure, les machines déployées ou installées sont accessibles de différentes manières : interface web, ligne de commande et bureau graphique.
Les différentes appliances disponibles sont listées et catégorisées dans le catalogue RAINBio. Ce catalogue comporte actuellement de nombreux modèles de machines virtuelles, fournissant différentes suites logicielles bioinformatiques dans différents domaines : génomique (assemblage, mapping, regulation, profil d'expression, annotation, visualisation, etc.), bio-imagerie, statistique (R), etc. Des environnements de base avec un système d'exploitation et des outils de développements sont également disponibles pour les développeurs.
Comme détaillé dans le tableau ci-dessous, les ressources disponibles sur le cloud IFB sont réparties entre 8 sites : le cloud de l’IFB-core et 7 Clouds de plateformes régionales de l’IFB et de mésocentres de calcul (GenOuest, PRABI-LBBE, BiRD, BiGest, Bilille, CBP-PSMN, AuBI), dont 2 en lien avec le GIS France Grilles.
| Plateforme | Localisation | Calcul (#CPU HT*) | Stockage (#TB) | RAM (#GB) |
|---|---|---|---|---|
| IFB Core | Lyon (CC-IN2P3) | 3 616 | 180 | 20 116 |
| AuBI | Clermont-Ferrand (Université) | 384 | 12 | 1 536 |
| GenOuest | Rennes (IRISA) | 600 | 350 | 2 600 |
| PRABI | Lyon (Université) | 536 | 144 | 3 300 |
| BiRD | Nantes (Université) | 860 | 150 | 2 500 |
| BIGEst | Strasbourg (IPHC) | 1 024 | 500 | 4 000 |
| BILILLE | Lille (Université) | 192 | 0 | 768 |
| CBP-PSMN | Lyon (ENS-Lyon) | 3 408 | 24 | 7 552 |
| Total fédération de clouds | 10 620 | 1 360 | 42 372 | |
La fédération de clouds propose un ensemble d'environnements préconfigurés, ce qui permet aux scientifiques et bioinformaticiens de choisir la configuration la mieux adaptée à leurs analyses. Ces environnements bioinformatique virtuels développés par certains membres de la communauté de l’IFB sont enregistrés dans le catalogue Biosphère. Les scientifiques et les ingénieurs peuvent lancer leurs propres environnements virtuels avec des ressources réservées qui peuvent être adaptées à leurs propres besoins sans interférer avec les autres utilisateurs. L'activité est en constante progression, et le cloud français de l'IFB a déjà été utilisé pour de nombreuses analyses scientifiques et des sessions de formation, des ateliers, des hackathons ou plusieurs sessions récurrentes d'écoles scientifiques ou d'universités.
Compléter le formulaire de demande de création de compte personnel
Un compte offre un espace variable (de 25 Go à 3 To par machine virtuelle pour la durée de l’exécution des travaux mais supprimé à l’extinction de la machine virtuelle) auquel sera prochainement associé un espace de stockage persistant et partagé entre les machines virtuelles d’un utilisateur ou d’un groupe.
Vous pouvez aussi utiliser le cloud IFB comme support pour vos formation : voir le détail
