Bienvenue à l’Institut Français de Bioinformatique

L'IFB est l’Infrastructure nationale de bioinformatique qui assure un support, déploie des services, organise des formations et réalise des développements innovants pour les communautés des sciences du vivant.

Rtrainer, l’application pour s’auto-former au langage R

RTrainer est un outil pédagogique innovant, pensé pour développer les compétences essentielles en analyse bioinformatique, à l’usage du langage R dans la communauté scientifique. Biologiste, étudiant, bioinformaticien, cette application est un outil d’auto-formation adéquat pour développer des compétences essentielles en analyse bioinformatique.

Développée en 2023 par Denis Puthier du TAGC à Marseille (équipe associée de l’Institut Français de Bioinformatique - IFB), RTrainer est disponible depuis mars 2025 pour l’auto-formation grâce à une collaboration avec les équipes de l’IFB-core. 

MassiveFold – l’outil pour révéler le plein potentiel d’AlphaFold

La biologie structurale a franchi un cap avec AlphaFold, l’outil de prédiction des structures protéiques développé par DeepMind, pour lequel Demis Hassabis et John Jumper ont reçu le prix Nobel de Chimie en 2024. D’abord conçu pour la prédiction de structures de protéines individuelles, AlphaFold a été étendu à l’étude des assemblages protéiques, mais ces prédictions nécessitent un échantillonnage massif, jusqu’ici limité par des coûts élevés en calcul et stockage. MassiveFold, une version optimisée d’AlphaFold, permet de lever ces freins en offrant des capacités d’échantillonnage avancées. Développé avec l’appui de l’IFB et en collaboration avec divers centres de calcul, MassiveFold ouvre de nouvelles perspectives pour la modélisation des structures protéiques. Pour en savoir plus, consultez l'article publié dans Nature Computational Science.