C’est avec une profonde émotion que nous avons appris le décès de notre collègue Jean-François Gibrat, survenu le 20 juin 2025. Fondateur puis directeur de l’Institut Français de Bioinformatique (IFB) jusqu’en 2017, il a aussi été l’un des pionniers de la bioinformatique en France. Auteur de 70 articles scientifiques, il a consacré plus de trois décennies à articuler développements méthodologiques et mise en place de services au bénéfice de la communauté des sciences de la vie.
Jean-François a développé sa carrière scientifique en Bioinformatique Structurale d’abord à l’Université d’Orsay puis sur le site INRA de Jouy-en-Josas où il est devenu directeur de recherche. Tout en produisant des connaissances scientifiques dans le domaine de la structure 3D des protéines, il a eu à cœur de développer les ressources et services collectifs dédiés à la bioinformatique. Il a ainsi participé à la création et pris la direction scientifique de la plateforme MIGALE, une des plateformes membre de l’IFB. De plus, il était aussi membre du comité scientifique du Grand Equipement National de Calcul Intensif (GENCI), une très grande infrastructure de recherche, et responsable du Réseau National des plateformes en Bioinformatique (ReNaBi). À ce titre, Jean-François a coordonné la rédaction du projet initial de l’IFB avant d’en devenir le premier directeur, depuis l’acceptation du projet en 2012 jusqu’en 2017. Il a ainsi été l’initiateur de l’infrastructure nationale distribuée, mis en place la gouvernance et créé l’unité mixte de coordination IFB-core. Il a également soutenu le développement des premiers services centraux de l'IFB (catalogue, cloud, formations, …) ainsi que des premiers projets de R&D de l’IFB, qui ont commencé à souder la communauté. Enfin, il a initié la participation de la France à l'infrastructure européenne de bioinformatique ELIXIR.
Jean-François était fortement engagé dans l'action collective, malgré ses nombreuses responsabilités, il était toujours disponible et à l'écoute pour résoudre un problème ou aborder une question scientifique. Capable d'une grande capacité d'intégration, il avait une vision pertinente sur les grandes orientations stratégiques et scientifiques de la bioinformatique au niveau national comme international. Sous son naturel discret, tous ses collègues de l'IFB ont pu apprécier son caractère jovial et son sens de l'humour.
Nous adressons nos plus sincères condoléances à sa famille, à ses proches et à ses anciens collègues.
Avec toute notre reconnaissance pour avoir posé les premières briques d'un projet fédérateur, qui rassemble aujourd'hui 35 plateformes et d'équipes de recherche, et mobilise plusieurs centaines de bioinformaticien·nes.
L’équipe de direction de l’Institut Français de Bioinformatique/ELIXIR-FR et ses anciens collègues de l’IFB