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Formation IFB Science Ouverte & PGD

Comment gérer des jeux de données haut-débit en sciences de la vie et de la santé (Session 2)

Dates : 15-18 novembre 2021 de 9h00 à 12h30 en visio (zoom)
Date limite d’inscription : 27 octobre 2021
Mode de formation : 4 demi-journées en distanciel synchrone

Présentation et application des principes FAIR de gestion des données dans un projet bioinformatique.

L’Institut Français de Bioinformatique (IFB) organise une formation à destination de bioinformaticiens, biologistes et médecins. La formation abordera les différents points fondamentaux (théoriques, pratiques, juridiques) en lien avec la politique nationale d’ouverture des données de la recherche et présentera sous forme de séances pratiques les ressources nationales accessibles à la communauté scientifique ainsi que les solutions proposées par l’IFB pour gérer les données d’un projet de recherche. La formation se déroulera en distanciel synchrone (via zoom) du 15 au 18 Novembre 2021 tous les matins de 9h00 à 12h30.

Objectifs pédagogiques

A la fin de cette formation, les participants connaîtront et pourront mettre en œuvre les principes de la science ouverte pour gérer leurs jeux de données dans un projet :

  • Les principes fondamentaux de l’Open Data en biologie et santé, y compris dans ses aspects juridiques ;
  • Les bonnes pratiques et outils de gestion des données d’un projet en bioinformatique, en lien avec les ressources de l’infrastructure IFB ;
  • Le PGD : séances théoriques et pratiques de construction d’un PGD sur des exemples de jeux de données omiques ;
  • Le choix des métadonnées : panorama des ressources existantes pour choisir des métadonnées et mise en pratique pour annoter des jeux de données omiques en vue de la publication des données dans une banque internationale ou un dataverse institutionnel.

Formateurs

Hélène Chiapello, Thomas Denecker, Frédéric de Lamotte, Jean-François Dufayard, Paulette Lieby, Gautier Sarah, Julien Seiler

 

IFB - Institut Français de Bioinformatique ♦ CNRS UAR 3601 ♦ IFB-Core, Génoscope - 2 rue Gaston Crémieux, 91057 - ÉVRY – CEDEX ANR-11-INBS-0013236
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